To πολυσυζητημένο firmware 3.21 του PS3 αφαίρεσε την δυνατότητα χρήσης άλλου λειτουργικού συστήματος στην κονσόλα, δυσαρεστώντας πολλούς χρήστες, κυρίως των Linux. Η Sony ζητάει συγνώμη από τους εν λόγω χρήστες, όμως τονίζει ότι είναι κάτι που έπρεπε να γίνει για να αντιμετωπιστούν κίνδυνοι που σχετίζονται με την πειρατεία. Επίσης, σύμφωνα με την εταιρία, οι όροι χρήσης του PS3 αναφέρουν ξεκάθαρα ότι έχει το δικαίωμα να κάνει τέτοιες αλλαγές στο σύστημα. Πάντως, ο περίφημος hacker George Hotz ισχυρίζεται ότι έχει στα σκαριά ένα «custom firmware» που επαναφέρει την επιλογή OtherOS και αναμένεται να το διαθέσει σύντομα.