Ως γνωστόν, το Prototype 2 έχει διαφορετικό πρωταγωνιστή από το αρχικό. O Sergeant James Heller αντικαθιστά τον Alex Mercer, ο οποίος πλέον είναι ο αντίπαλός σας στο παιχνίδι. Ο Heller κοσμεί το εξώφυλλο του νέου τεύχους του περιοδικού EGM και μπορείτε να τον θαυμάσετε εδώ. Άλλο φρικιό μας βρήκε! Το Prototype 2 αναμένεται το 2012.